“เงินเพิ่มพิเศษสำหรับผู้บริหาร” เป็นผลมาจากการปรับโครงสร้างเงินเดือนของข้าราชการ เมื่อเดือนเมษายน 2547 ซึ่งไม่เคยมีการปรับมาเกือบ 10 ปี โดยได้มีการปรับขึ้นเงินเดือนให้ข้าราชการทั้งระบบ 3% เท่ากัน อันเป็นไปตาม เงื่อนไขที่กฎหมายเงินเดือนและเงินประจำตำแหน่งได้กำหนดไว้ว่าต้องปรับขึ้นเท่ากันหมด ทั้งนี้ หากปรับขึ้นไม่เกิน 10% ก็สามารถทำเป็นพระราชกฤษฎีกาได้ (ดูมาตรา 14)

            สำหรับข้าราชการระดับซี 1 ถึง ซี 7 นั้น รัฐบาลก็ได้มีนโยบายให้ความดีความชอบเป็นกรณีพิเศษเพิ่มเติม ให้อีก 2 ขั้นแก่ข้าราชการทุกคน (ประมาณเท่ากับ 8%) รวมปรับขึ้นทั้งหมดเป็น 11% อย่างไรก็ดี การปรับขึ้นดังกล่าวนั้น เป็นการปรับเพิ่มหลังจากการประเมินรอบ 6 เดือนแรกของปีนั้น (31 มีนาคม 2547) ถ้าใครได้เลื่อน .05 หรือ 1 ขั้น (เทียบได้ประมาณ 2- 4%) ก็จะนำไปปรับเพิ่มในฐานเงินเดือนก่อนคำนวณ 11% อันเป็นผลให้มีการปรับเงินเดือน ข้าราชการระดับซี 1 ถึง ซี 7 ขึ้นไปรวมทั้งสิ้นอยู่ประมาณ 13%-15% และถือเป็นการปรับเข้าไปในฐานเงินเดือน ของแต่ละคนอย่างถาวร (ต่อมายังได้มีการปรับปรุงเงินเดือนค่าตอบแทนอีกครั้งหนึ่งและยังได้มีมาตรการเสริม ให้แก่ข้าราชการชั้นผู้น้อยเพิ่มเติมอีกเป็นการเฉพาะ)

            ในส่วนของผู้บริหารสูงสุดของแต่ละหน่วยงาน (CEO) นั้นเป็นการปรับเข้าสู่ระบบใหม่เรียกว่า Senior Executive System ซึ่งเป็นการเตรียมการรองรับระบบในอนาคตที่ต้องการให้ตำแหน่งผู้บริหารสูงสุดดังกล่าวมีลักษณะการจ้าง เป็นวาระคราวละ 4 ปี เช่นเดียวกับผู้บริหารของรัฐวิสาหกิจ โดยผู้บริหารสูงสุดของ แต่ละหน่วยงานต้องมีการประเมินผล ตามคำรับรองการปฏิบัติราชการที่ได้ลงนามไว้กับผู้บังคับบัญชา และต้องรับผิดชอบต่อผลการปฏิบัติงานทั้งหมด ตามคำรับรองที่ได้ทำไว้ ถ้างานไม่ได้ผลตามเป้าหมายก็ให้มีมาตรการลงโทษ เช่น ถอดถอนจากการไปดำรงตำแหน่ง ในรัฐวิสาหกิจและอื่นๆ หรืออาจโยกไปไว้ในตำแหน่งอื่นแทน หรือเข้าสู่บัญชีผู้บริหาร/อัตราสำรองราชการแทน (ปัจจุบันยังไม่ได้ดำเนินการ)


          เมื่อพิจารณาถึงความแตกต่างในโครงสร้างเงินเดือน (ก่อนปรับเดือนเมษายนปี 2547) กับราคาเงินเดือน ในตลาดนั้นพบว่า ตอนเริ่มเข้ารับราชการจบปริญญาตรีจะได้รับเงินเดือนประมาณ 6,000 บาทแล้วเงินเดือนขั้นสูงสุด   ในระดับ 11 จะอยู่ที่ประมาณ 60,000 บาท ฉะนั้น ความแตกต่างในช่วงแรกเข้ารับราชการ กับราคาตลาดอยู่ประมาณ 2 เท่า (จบปริญญาตรี เข้าทำงานภาคเอกชนได้รับประมาณ 12,000 บาท) แต่สมมุติ เมื่อรับราชการต่อไปจนถึงระดับ 11 ขั้นสุดท้ายจะได้รับประมาณ 60,000 บาท ซึ่งแตกต่างจากราคาตลาดประมาณอย่างน้อย 5 เท่า สาเหตุก็เพราะโครงสร้าง เงินเดือนราชการเป็นแบบเส้นตรง (linear) ฉะนั้น จึงได้มีการปรับอัตราค่าตอบแทนของตำแหน่งปลัดกระทรวง เป็น 150,000 บาท อธิบดี/ผู้ว่าราชการจังหวัด 120,000 บาท เป็นต้น อันเป็นผลทำให้ความแตกต่างกับตลาด ก็จะเหลือเพียง 3 เท่า

            ผลจากการปรับดังกล่าว ทำให้ช่วงระยะห่างตั้งแต่ ซี 3 จนถึง ซี 11 กับตลาดอยู่ระหว่าง  2-3 เท่า ตลอดช่วงเวลา การรับราชการ ก็จะทำให้เกิดความเป็นธรรมมากขึ้นในทุกระดับ ทั้งนี้ มีเงื่อนไขว่า เงินเดือนที่ได้รับ 150,000 บาท หรือ 120,000 บาท นั้น จะต้องเอา เงินเดือนจริงที่ได้รับ รวมกับ เงินเพิ่มพิเศษต่างๆ ไปหักออกก่อน แล้วยังถูกถ่วงน้ำหนัก ด้วยผลการประเมินการปฏิบัติงานตามคำรับรองประจำปี ยอดคงเหลือก็คือ เงินเพิ่มพิเศษของผู้บริหาร โดยให้จ่ายเป็นงวดๆ ละ  6 เดือน ซึ่งวิธีการจ่ายดังกล่าวมีข้อดีคือ ไม่ไปผูกพันกับฐานเงินเดือนอันจะมีผลระยะยาวต่อการคำนวณบำเหน็จ บำนาญ และดีกว่าเงินเพิ่มพิเศษประจำตำแหน่งที่เคยใช้กันมาซึ่งผู้บริหารได้รับอัตโนมัติไปเลยในแต่ละเดือน ไม่ได้สะท้อนให้เห็นถึงผลงาน (โปรดดูแผนภาพประกอบ)